华南农业大学对于专业培养目标的修订有较为完善的制度，总体上与培养方案一起遵循4年一大修、2年一小修的原则，特殊情况下，专业可以提出更改评价与修订的时间。 2017年在2015版本的基础上进行了微调，形成了2017版本；根据学校培养计划修订制定和工程教育认证新标准，从2019年开始由专业负责人牵头、专业教师参与座谈研讨，听取并记录教师对培养目标的建议、意见和要求，并收集应届、校友及用人单位对培养目标的反馈意见，分析内外部需求对2017版本进行了较大的修订，并明确了社会使命，强调了专业特色，增加了毕业生职业能力，形成2020版本。三个版本的培养目标如下。

 2015版本：

本专业旨在培养①具备适应现代化建设和适应经济、科技、社会发展需要，德智体美全面发展和健康个性和谐统一的，富有科学创新精神和科学的思维及较强实践能力, 掌握数理化、生物和农业等相邻学科的自然科学知识和专业知识及技能，基础扎实、知识面宽、能力强的；②能在食品行业或其它企业从事生产技术管理、新产品开发和经营、科学研究、工程设计、质量控制与安全评价、营养指导及市场营销等方面工作，也能够进一步攻读本专业及相关专业硕士学位的，高素质食品科学与工程方面的应用型、复合型毕业生。

 2017版本：

本专业旨在培养①具备适应现代化建设和适应经济、科技、社会发展需要，德智体美全面发展和健康个性和谐统一的，富有科学创新精神和科学的思维及较强实践能力, 掌握扎实的食品科学与工程专业基本原理、方法和手段等方面的基础知识与理论，了解本专业的前沿发展现状和趋势，熟练本专业实验技能、工程实践、计算机运用、科学研究与工程设计方法等技能；②能在食品行业或其它企业从事生产技术管理、新产品开发和经营、科学研究、工程设计、营养指导及市场营销等方面工作，也能够进一步攻读本专业及相关专业硕士学位的，高素质食品科学与工程方面的应用型、复合型毕业生。

 2020版本：

根据社会对专业需求、高校人才培养要求、工程教育认证标准要求，结合专业跟踪调查结果和校内外同行及企业专家建议，并经学院教学委员会审议、学校教学委员会审定，确定食品科学与工程专业培养目标为：①以培养具备适应现代化建设和适应经济、科技、社会发展需要，德智体美劳全面发展和健康个性和谐统一的社会主义事业建设者和接班人为总目标；②富有科学创新精神和科学的思维及较强实践能力, 掌握扎实的食品科学与工程专业基本原理、方法和手段等方面的基础知识与理论，了解本专业的前沿发展现状和趋势，熟练食品科学与工程实验技能、工程实践、计算机运用、科学研究与工程设计方法等技能；③能在食品行业（尤其是岭南特色食品加工）或其它企业从事生产技术管理、新产品开发和经营、科学研究、工程设计、营养指导及市场营销等方面工作，毕业5年能到达中级以上专业水平，职业能力达到经理级别；同时也能够进一步攻读本专业及相关专业硕士学位的，高素质食品科学与工程方面的应用型、复合型工程技术人才。