华南农业大学食品科学与工程学科历史悠久，起始于1930年代广东大学农科学院利寅先生开展的酱油、肉品研制，以及后来李沛文先生开展的果蔬贮藏研究；20世纪50年代李永禄教授创建乳品加工实验室，逐渐形成了如今“华农酸奶”品牌原型。1981年获批农产品加工及贮藏工程硕士学位授权点，是国内最早招收食品类研究生的单位之一，1994年成立食品科学系。学校坐落于素有“花城”美誉的广州，地处改革开放前沿，是粤港澳大湾区的核心城市，拥有独特的地理优势和发展机遇。本专业现有在校生407人，每年平均招生约102人。
在长期的办学实践中，本专业形成了一支实力雄厚的师资和科研力量。现有教师35名，其中教授13名、研究员1名、副教授17名、副研究员1名。博士生导师6名，硕士生导师34名。具博士学位的教师占91.4%，硕士及以上学位教师占100%，有工程学历背景教师占82.9%，教师100%有工程实践经验。优秀的师资和较强的科研实力使本专业在国内具有较高的知名度与学术地位。
本专业于2006年获批广东省名牌专业、2007年获批国家级特色专业，2012年获批广东省第一层次建设的攀峰重点学科，2014年入选国家卓越农林人才培养计划。拥有食品科学与工程一级学科硕士、博士学位授权点和博士后流动站。建有畜禽产品精准加工与安全控制技术国家地方联合工程研究中心、广东省重点实验室等省部级平台12个。主持获国家教学成果奖1项、省级教学成果奖3项，有国家万人计划教学名师1名，国家级精品资源共享课程2门、国家精品在线开放课程2门、国家级双语教学示范课程1门、省级精品资源共享课5门、省级一流课程3门。围绕华南地区的“资源特点”、“地理优势”和“技术优势”，经过多年的发展和凝练，形成了“从原料到餐桌”的“热带亚热带农产品贮藏加工及全程控制”明显的热带亚热带区域特色，成为华南地区农产品、食品加工领域重要的教学科研和人才培养基地。